Son günlerde Milliyeti Hareket Partisi Lideri Devlet Bahçeli’nin ‘af’la ilgili yaptığı açıklamaları da eleştiren Karamollaoğlu, “Seçim öncesi af konuşulması ve çıkarılmasını doğru bulmuyorum. Aynen seçim öncesi emekliye bin Türk Lirası ikramiye verilmesi gibi. Bunlar seçim rüşvetinden başka bir şey değil kanaatimce. Seçim öncesinde acele bir şekilde bu tarz konular gündeme geliyor. Bekle seçimden sonra yap. Bunları neden seçimden sonra yapmıyorsun?” diye konuştu. Karamollaoğlu, devlet yönetiminde kuvvetler ayrılığı olması kanaatine sahip olduklarını ifade ederek, “Tek kişinin kuralları koyduğu, kararları aldığı, adaleti uyguladığı bir sistemde, farklı düşüncelerin tartışılmasına dahi fırsat verilmeyen, vatana ihanete kadar giden suçlamalar olursa farklı fikirler için de bunun kabul edilebilirliği yok” dedi. Yürütmenin kamu adına hükümet eli ile yapıldığını, denetleme işinin kamu adına meclis tarafından yapılması gerektiğini anlatan Karamollaoğlu, “Adalet bu iki kurumun tamamen dışında olmalıdır. Kuralları meclis koyar, kanun çıkarır ama kanun uygulanması noktasında müdahale edemez" diye konuştu.